Study of the impact of arginine-methylation on the activity of the main effector of RNA silencing in A. thaliana : a new flavour of AGO1
Étude de l'impact de la méthylation sur arginine sur l'activité du principal effecteur du RNA silencing chez A. thaliana : la protéine AGO1
Résumé
ARGONAUTE1 (AGO1) is the main effector of Post Transcriptional Gene Silencing (PTGS) in Arabidopsis and it is involved in many aspects of plant development and in plant defense against pathogens. Therefore, its homeostasis and activity are tightly fine-tuned to avoid deleterious side effects. One well-known example of these levels of regulation is the retrocontrol of AGO1 expression by miR168 (Mallory and Vaucheret, 2010). The main objective of our PhD project is to study a layer of regulation of the Argonaute 1 protein which is still poorly investigated. We are interested in understanding the impact of post-translational modifications (PTM) of AGO1 on its activity in Arabidopsis thaliana. This project will focus on one signature that we identified on AGO1. Plants expressing an AGO1 protein harboring a specific mutation that abolishes this PTM are available in the null mutant background and are viable. The PhD student will take in charge the phenotyping of these plants, including plant development and plant defense responses against pathogens. Complementary approaches to address the effect of this PTM on AGO1 activity will be assessed by introducing these lines into known PTGS sensor lines. All the collected data should allow us to set up a reference line to initiate hereafter a genetic screen in order to identify actors of this novel regulation pathway of AGO1 in Arabidopsis thaliana.
La protéine ARGONAUTE1 (AGO1) est le principal effecteur de voies de Post Transcriptional Gene Silencing (PTGS) chez Arabidopsis. Elle est impliquée dans de nombreux aspects du développement de la plante et dans la défense contre l'invasion de pathogènes. Par conséquent, son activité et son homéostasie doivent être très contrôlées, comme le montre notamment l'existence d'une boucle de rétroaction assurée par le miRNA miR168 (Mallory and Vaucheret, 2010). Le projet proposé est destiné à étudier une nouvelle voie de régulation post-traductionnelle de la protéine AGO1 chez Arabidopsis thaliana. Nous avons identifié une signature/modification post-traductionnelle portée par AGO1, dont le rôle devra être analysé au cours du développement de la plante et dans le cadre de la réponse contre l'attaque de pathogènes. Pour y parvenir, l'étudiant(e) disposera de lignées exprimant une version d'AGO1 spécifiquement mutée sur ces sites. Ces lignées, produites dans un fond mutant ago1 nul, sont viables et devront être caractérisées au niveau phénotypique et niveau moléculaire. Pour compléter ce dernier point, elles seront introduites dans des lignées senseurs connues de diverses voies de RNA silencing pour tester le rôle de cette modification dans les fonctions associées à AGO1. L'ensemble de ces analyses contribuera à générer une lignée de référence pour un crible génétique qui sera initié à la suite de ce projet, afin d'identifier de nouveaux acteurs spécifiques de cette voie régulant AGO1.
Origine | Version validée par le jury (STAR) |
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